Halieutiquement et réglementairement, on distingue les cours d’eau en deux catégories piscicoles :
La première catégorie piscicole est représentée par une population piscicole à dominante salmonicole comme par exemple la truite, ainsi que des espèces accompagnatrices comme le chabot ou le vairon. Ce sont principalement de petits cours d’eau situés en amont des bassins versants avec des eaux fraiches et bien oxygénées.
La deuxième catégorie piscicole est représentée par une population piscicole à dominante cyprinicole comme par exemple le gardon ou la brème. Ce sont des cours d’eau situés sur les parties intermédiaires et les parties aval des bassins versants avec des eaux moins oxygénées et des vitesses d’écoulements modérées à faibles.